海運虧艙費是指在海運拼箱出口過程中，在截單截貨日前一工作日的中午11點以后（實際工作中可默認為截單截貨期的前一個工作日），因訂艙人自身的原因造成貨物無法及時出運，從而導致拼箱公司整個集裝箱艙位空置的，拼箱公司為彌補該損失而向訂艙人所收取的費用。
一般走海運的話，拼箱公司會在規定的截單截貨日期的前一個工作日，根據每位客戶訂艙時所訂貨物的具體數據（毛重&體積&包裝等），選擇最為合適的裝載，也是最為節約成本的箱型搭配，力爭把所有客戶訂艙出運的貨物配箱裝船出運。
在這個時間前如果被通知有某位客戶的貨物因各種原因而無法及時出運的，可以通過箱型調配及同行間換貨來控制成本和保障利潤。但是如果過了這個時間而仍有部分貨物無法出運的，就會導致整個集裝箱艙位的空置，而這空置的艙位則是付出成本的。
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