跨境電商企業(yè)通過電子賬冊進口保稅商品至海關特殊監(jiān)管區(qū)域，然后再根據(jù)電商平臺的訂單分拆出區(qū)銷售。在這物流過程中，由于管理不善，物流和信息流沒有一一對應，就會導致進區(qū)和出區(qū)申報數(shù)據(jù)不一致，造成進口保稅跨境電商商品的實際庫存少于海關電子底賬數(shù)量。
保稅商品入?yún)^(qū)申報后，電子底賬數(shù)據(jù)增加。而網(wǎng)購保稅進口商品零售出區(qū)申報時，主管海關審核電子商務企業(yè)申報的《中華人民共和國海關跨境電子商務零售進口商品申報清單》，電子賬冊底賬數(shù)據(jù)進行相應核減。
而且海關根據(jù)監(jiān)管需要，結(jié)合風險程度，對參與網(wǎng)購保稅進口業(yè)務的倉儲企業(yè)采取全盤、抽盤等方式進行盤庫，并將電子底賬核算結(jié)果與實際庫存量進行對比，分別進行以下處理：
(一)實際庫存量多于電子底賬核算結(jié)果的，按照實際庫存量調(diào)整電子底賬的當期余額；
(二)實際庫存量少于電子底賬核算結(jié)果且企業(yè)可以提供正當理由的，對短缺的部分，責令企業(yè)參照貨物辦理后續(xù)補稅手續(xù)。
近期成都海關和福州海關等地對跨境電子商務平臺企業(yè)的電子賬冊開展保稅核查作業(yè)，均發(fā)現(xiàn)企業(yè)實際庫存較海關底帳短少。由于當事企業(yè)無法提供正當理由而被海關處罰并補繳稅款。
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