進口清關公司過程中比較麻煩的還是單證的問題。很多企業餅干 開始報關之后才發現單證不全，或是信息不符，這時候就算讓國外重新辦理，來回也要半個月，報關時間拖得越是久，產生的費用越是高不說，長時間沒報關完成的貨物也會引起商檢、海關的高度關注，到時候想順順利利報關就更難了。所以單證這程不容小視，這跟找的貨代公司是否專業有很大關系，正常來說報關代理公司一個經 豐富的代理公司，拿到單證之后會先進行初步審單，確認無誤才開始申報。
進口報關代理而涉及到進口的費用來說，一般貿易進口明顯高于快件進口的。因為它要求征收的所有費用和稅都是針對于單貨物來進行的，不過由于它能提供所對應的發和稅明，顧及到有這方面需要的公司來說，這些都是必不可少的。快件進口的缺點是不能夠向顧客單獨開具海關所征收的各種發，因為它在進口的過程是整個一批貨物所產生的進口關稅和增價稅，上海進口代理公司并且這部分稅在進口時由所委托的物流公司當抵扣掉了。但是如有對據方面的需要，也可通過其它途徑辦理也是合法的。由于快件進口所花費的時間和費用都比一般貿易少很多，所以有很多聰明的客戶選擇快件進口方式。
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